Die wärmsten Monate sind normalerweise August und Juli, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 19 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Februar mit einer Durchschnittstemperatur von 2 °C. Den meisten Schneefall sieht Kjustendil im November, Januar, Dezember und Februar, mit durchschnittlich 18 cm Schnee pro Monat.