Das Wetter ist sicherlich ein entscheidender Faktor für deinen Aufenthalt in Moyobamba. Gerade dann, wenn sich das Wetter nicht von seiner besten Seite zeigt, sind die Angebote meist umso attraktiver. Die wärmsten Monate sind normalerweise September und Oktober, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 21 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 20 °C. In Moyobamba fällt der meiste Regen im März, April, Februar und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 324 mm pro Monat.